A missão do Departamento de Engenharia Naval e Oceânica (PNV) é formar recursos humanos qualificados, tanto em nível de graduação como de pós-graduação em Engenharia Naval, Engenharia Oceânica, transporte e planejamento portuário, além de promover pesquisa e desenvolvimento para atender aos desafios tecnológicos demandados por essas áreas. Os desafios compreendem o aperfeiçoamento da dinâmica do transporte marítimo, inovações no projeto e construção dos navios, bem como o desenvolvimento de tecnologias que possibilitam a exploração do petróleo em águas profundas.
 
Para oferecer alternativas de solução aos diversos problemas tecnológicos, o Departamento tem mantido linhas de pesquisa em consonância com a realidade da indústria brasileira. Cada linha de pesquisa acomoda diversos projetos que são financiados pelos órgãos oficiais de fomento e também por meio de convênios firmados entre empresas públicas e privadas e a universidade. Como o desenvolvimento desses projetos está em sintonia com o programa de pós-graduação do Departamento, tem-se naturalmente o aperfeiçoamento dos recursos humanos com a formação de mestres e doutores com sólido embasamento tecnológico e científico.