Um Departamento é a menor fração da estrutura universitária, e é o órgão responsável pela elaboração e desenvolvimento dos programas de Ensino, Pesquisa e Extensão Universitária.
A direção de cada Departamento é exercida por um chefe eleito entre os membros do Conselho de Departamento, que é constituído por professores titulares, representantes das demais categorias docentes e representantes discentes.
A escola Politécnica da USP possui 15 departamentos: